Обращение облигаций на вторичном рынке осуществляется только после совершения сделок купли-продажи через торговую систему. До начала торгов дилер резервирует на "торговых" субсчетах расчётной системы и депозитария необходимые денежные средства и облигации. Торговая система получает по каждому дилеру данные. Дилеры подают разовые заявки с указанием направления сделки (купля или продажа), количества облигаций, цены и кода покупателя или продавца. При поступлении заявки на покупку торговая система уменьшает величину денежных средств, которые могут служить обеспечением следующих заявок на покупку, на сумму, необходимую для полного удовлетворения поданной заявки. Если результат отрицателен, то данная заявка к исполнению не принимается. При поступлении заявки на продажу, торговая система уменьшает количество облигаций, которые могут служить обеспечением следующих заявок на продажу, на количество, необходимое для полного удовлетворения поданной заявки. Заключение сделки происходит автоматически и дополнительного согласия дилера не требует. Если заявка удовлетворена не полностью, то её неисполненная часть остаётся в очереди в качестве отдельной заявки. Заявки удовлетворяются в зависимости лишь от цены и времени подачи, а размер заявки на её приоритет не влияет. Независимо от времени подачи заявка, имеющая более выгодную цену, удовлетворяется раньше, чем заявка с менее выгодной ценой. При равенстве цен, заявка, проданная раньше, удовлетворяется в первую очередь. Любая заявка дилера может быть снята самим дилером, если она к этому времени не удовлетворена. При снятии неисполненной заявки сумма денежных средств или количество облигаций, зарезервированных для обеспечения данной заявки, добавляется к сумме денежных средств или облигаций, служащих обеспечением следующих заявок для данного дилера. После окончания торгов торговая система определяет чистое сальдо денежных средств, которые должны быть переведены или зачислены на корреспондентский или текущий счёт каждого дилера в расчётной системе, а также чистое сальдо облигаций, которые должны быть переведены или зачислены на счета "депо" каждого дилера в депозитарии.